Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms