Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms