Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atoh8Q99NA2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms