Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms