Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms