Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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