Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms