Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99KU6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99KU6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q99KU6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q99KU6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q99KU6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q99KU6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q99KU6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q99KU6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q99KU6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q99KU6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q99KU6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q99KU6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q99KU6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q99KU6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q99KU6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q99KU6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q99KU6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q99KU6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q99KU6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q99KU6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms