Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Vmp1Q99KU0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Vmp1Q99KU0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Vmp1Q99KU0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmp1Q99KU0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmp1Q99KU0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmp1Q99KU0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmp1Q99KU0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Vmp1Q99KU0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Vmp1Q99KU0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Vmp1Q99KU0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Vmp1Q99KU0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vmp1Q99KU0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmp1Q99KU0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmp1Q99KU0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vmp1Q99KU0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmp1Q99KU0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vmp1Q99KU0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vmp1Q99KU0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Vmp1Q99KU0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Vmp1Q99KU0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Vmp1Q99KU0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmp1Q99KU0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmp1Q99KU0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmp1Q99KU0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vmp1Q99KU0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmp1Q99KU0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmp1Q99KU0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmp1Q99KU0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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