Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ciao1Q99KN2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms