Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms