Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms