Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms