Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ttc30a1Q99J38 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ttc30a1Q99J38 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc30a1Q99J38 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ttc30a1Q99J38 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Ttc30a1Q99J38 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ttc30a1Q99J38 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ttc30a1Q99J38 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ttc30a1Q99J38 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc30a1Q99J38 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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