Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms