Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn16Q925N4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn16Q925N4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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