Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Csmd1Q923L3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csmd1Q923L3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
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