Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms