Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms