Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms