Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SncbQ91ZZ3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms