Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms