Protein–RNA interactions for Protein: Q91YU3

Msantd4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd4Q91YU3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msantd4Q91YU3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms