Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI47

Abcc2, Canalicular multispecific organic anion transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc2Q8VI47 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc2Q8VI47 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms