Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms