Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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