Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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