Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC56

Rnf8, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf8Q8VC56 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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