Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms