Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ccdc58Q8R3Q6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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