Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slf1Q8R3P9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms