Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms