Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg10Q8R1P4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg10Q8R1P4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg10Q8R1P4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms