Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Hoxc12Q8K5B8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Hoxc12Q8K5B8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Hoxc12Q8K5B8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Hoxc12Q8K5B8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Hoxc12Q8K5B8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Hoxc12Q8K5B8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Hoxc12Q8K5B8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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