Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hecw1Q8K4P8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms