Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OptnQ8K3K8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms