Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms