Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Abcf3Q8K268 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Abcf3Q8K268 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Abcf3Q8K268 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Abcf3Q8K268 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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