Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sde2Q8K1J5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms