Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms