Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms