Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh4a1Q8CHT0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh4a1Q8CHT0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms