Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ep400Q8CHI8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms