Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms