Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms