Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE8

Spdye4b, 4933411G11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4bQ8CDE8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4bQ8CDE8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms