Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms