Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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