Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A430089I19RikQ8C9W1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms