Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms